Первые упоминания о библиотеке музея местного края встречаются в документах 1925 года. Фонд пополнялся за счет поступлений от частных лиц, общественных городских библиотек, библиотек учебных заведений Череповца, Земской Управы, обмена с краеведческими обществами и другими путями. Библиотека получила статус научной в 1967 г.
Фонд библиотеки определяется ее спецификой музейной библиотеки. Основные отделы библиотеки соответствуют профилю музеев, входящих в ЧерМО. Это искусство, история, естественные науки, этнография, литературоведение, краеведение, музееведение. Фонд библиотеки насчитывает более 37 000 единиц: книги, брошюры, журналы, изопродукция.
В 1990 году собрание пополнилось библиотекой известного ленинградского литературоведа академика М. П. Алексеева, которое на треть состоит из изданий на иностранных языках.
Библиотека располагает интересным собранием детской литературы 50 – 70-х годов – наследием известного краеведа А. А. Алексеевой.
В библиотеке ежегодно, со времени основания, выписывают все местные периодические издания.
